Estes sistemas são específicos e especiais pois no ambiente hospitalar há necessidade de se controlar além da temperatura, a umidade e a filtragem do ar. Os setores críticos necessitam equipamentos de aplicação hospitalar diferenciados daqueles de conforto: cuidados com o ruído, isolamento interno do equipamento, controles para automação, proteções elétricas e facilidades de manutenção.
Os ambientes mais críticos como: UTI Geral, UTI Neo-Natal, Centros Cirurgicos, Salas de Recuperação, Sites de Ressonância Magnética, Sites de Tomografia, Sites de Hemodinâmica, Salas de Emergência e Quarto de Isolamento, necessitam de cuiaddos extras quanto ao controle de umidade e qualidade na filtragem do ar, bem como na pressão do ambiente. Seguir as orientações dos fabricantes dos equipamentos.
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